Desde o início da pandemia, os testes de diagnóstico têm desempenhado um papel vital no controlo da propagação do SARS-CoV-2, o vírus que causaCOVID 19.Testes rápidos de antígenorealizados em casa ou em ambiente clínico fornecem resultados em 15 minutos ou menos.Quanto mais cedo uma pessoa for diagnosticada, mais cedo ela poderá procurar atendimento médico e se isolar dos outros.Mas quando aparecem novas variantes do vírus, essas variantes podem não ser detectadas por estes testes.
A maioria dos testes rápidos de antígeno são projetados para detectar a proteína ou proteína N do nucleocapsídeo SARS-CoV-2.Esta proteína é encontrada em abundância em partículas virais e pessoas infectadas.Kit de teste rápidos geralmente contêm dois anticorpos diagnósticos diferentes que se ligam a diferentes partes da proteína N.Quando um anticorpo se liga à proteína N numa amostra, uma linha colorida ou outro sinal aparece no kit de teste, indicando uma infecção.
A proteína N consiste em 419 unidades estruturais de aminoácidos.Qualquer um deles pode ser substituído por outro aminoácido por mutação.Grupo de pesquisa liderado pelo Ph.D.Philip Frank e Eric Ortlund, da Emory University, decidiram investigar como essa alteração em um único aminoácido afeta o desempenho de um teste rápido de antígeno.Eles usaram uma técnica chamada varredura profunda de mutações para avaliar simultaneamente como cada mutação na proteína N do vírus afeta a ligação a um anticorpo diagnóstico.Seus resultados foram publicados na Cell em 15 de setembro de 2022.
Os pesquisadores criaram uma biblioteca abrangente de quase 8.000 mutações na proteína N.Estas variantes representam mais de 99,5% de todas as mutações possíveis.Eles então avaliaram como cada variante interagia com 17 anticorpos diagnósticos diferentes usados ​​em 11 testes rápidos de antígeno comercialmente disponíveis, incluindo testes comunskits para casa.
A equipe avaliou quais mutações na proteína N afetam o reconhecimento de anticorpos.Com base nesta informação, eles criaram um “perfil de mutação de escape” para cada anticorpo diagnóstico.Este perfil identifica mutações específicas na proteína N que podem afetar a capacidade do anticorpo de se ligar ao seu alvo.A análise mostrou que os anticorpos usados ​​nos testes rápidos de hoje reconhecem e ligam todas as variantes passadas e presentes do SARS-CoV-2 que preocupam e preocupam.
Embora vários anticorpos de diagnóstico reconheçam a mesma região da proteína N, os investigadores descobriram que cada anticorpo tem uma assinatura única de mutações de escape.À medida que o vírus SARS-CoV-2 continua a sofrer mutações e a gerar novas variantes, estes dados podem ser utilizados para sinalizar anticorpos do kit de teste que podem necessitar de ser reavaliados.
“A identificação precisa e eficiente de indivíduos infectados continua sendo uma estratégia crítica para a mitigação da COVID-19, e nosso estudo fornece informações sobre futuras mutações do SARS-CoV-2 que podem interferir na detecção”, disse Ortlund.“Os resultados aqui descritos permitem-nos adaptar-nos rapidamente a este vírus à medida que novas variantes continuam a surgir, apresentando implicações clínicas e de saúde pública imediatas.”
Antecedentes: O Mutation Deep Scan detecta mutações de escape no nucleocapsídeo SARS-CoV-2 usando testes rápidos de antígeno atualmente disponíveis.Frank F., Kin MM, Rao A., Bassit L., Liu H, Bowers HB, Patel AB, Kato ML, Sullivan JA, Greenleaf M., Piantadosi A., Lam VA, Hudson VH, célula Ortlund EA.2022 15 de setembro;185(19):3603-3616.e13.Ministério do Interior: 10.1016/j.cell.2022.08.010.29 de agosto de 2022 PMID: 36084631.
Financiamento: Instituto Nacional de Imagens Biomédicas e Bioengenharia NIH (NIBIB), Instituto Nacional de Diabetes, Doenças Digestivas e Renais (NIDDK) e Instituto Nacional de Alergia e Doenças Infecciosas (NIAID), American Heart Association.
NIH Research Matters é uma atualização semanal das principais descobertas de pesquisas do NIH revisadas por especialistas do NIH.É publicado pelo Gabinete de Comunicações e Relações Públicas do Diretor dos Institutos Nacionais de Saúde.